On croyait que l'utilisation de pilules contraceptives de la génération précédente, qui contiennent beaucoup d'œstrogènes, augmentait le risque de maladies cardiovasculaires, probablement parce que, alors que leur réception était déterminée, les changements dans les niveaux de triglycérides ( graisses dans le sang). Bien qu'il n'existe aucune preuve concluante que les pilules à faible teneur en œstrogène utilisées aujourd'hui augmentent réellement ce risque, bien que la progestérone qu'elles contiennent ait encore un effet insignifiant sur les lipides sanguins. Inclus dans les pilules, les œstrogènes inhibent dans une certaine mesure la sécrétion et inhibent l'effet de la sécrétion de progestérone, empêchant ainsi la formation de plaques d'athérosclérose et les maladies cardiaques. Chez les femmes qui fument, au contraire, l'utilisation de contraceptifs oraux augmente le risque de caillots sanguins pouvant provoquer des crises cardiaques, des accidents vasculaires cérébraux et d'autres troubles circulatoires. Les pilules combinées ne sont généralement pas recommandées aux femmes fumeuses de 35 ans et plus. Cependant, ce type de contraception n'est généralement pas le meilleur pour ceux qui fument, quel que soit leur âge.
Il n'est pas recommandé de l'utiliser pour les femmes qui ont un diagnostic d'hyperlipidémie (taux élevés de lipides dans le sang) , ceux qui souffrent d'une maladie cardiaque ou qui ont souffert de lupus érythémateux disséminé, d'accident vasculaire cérébral, d'une violation de l'hématopoïèse et de la coagulation sanguine (par exemple, une thrombophlébite) et d'un cancer du sein ou de l'utérus, d'une maladie hépatique grave, de saignements vaginaux anormaux de nature inconnue dans l'histoire. D'autres moyens de contraception sont également présentés aux femmes qui souffrent de migraines, d'hypertension artérielle, de diabète, de dépression et d'anémie falciforme. Contrairement aux croyances po[censurées]r, les pilules contraceptives ne sont pas contre-indiquées chez les patientes atteintes de fibrose de l'utérus ou de varices, car elles n'augmentent pas le risque pour la santé globale.
Pour les adolescentes, il est préférable de différer l'application de les pilules contraceptives pendant environ six mois avec la première période menstruelle pour ne pas supprimer prématurément la croissance et la formation du tissu osseux. Les contraceptifs oraux combinés sont contre-indiqués pour les mères qui allaitent.
Les femmes souffrant d'hypertension devraient penser à l'utilisation de ce qu'on appelle des mini-pilules qui ne contiennent que de la progestérone, car elles ne contiennent pas affecter la tension artérielle. Mini-pilules - le meilleur choix pour les femmes atteintes de diabète, car ces médicaments ont peu d'effet sur la tolérance au glucose. Il est préférable de les utiliser chez les patients souffrant de migraines constantes. Cependant, il convient de noter que la réception de mini-pilules entraîne souvent une perturbation du cycle menstruel, en particulier des saignements, et peut provoquer les mêmes effets indésirables que de simples médicaments combinés - modifications du poids corporel et de l'appétit, œdème, dépression , engorgement, apparition d'acné et d'hirsutisme (augmentation de la pousse des cheveux). Si, lors de la prise de mini-pilules, une femme tombe enceinte, elle a un risque très élevé de grossesse extra-utérine, probablement en raison d'une plus faible vitesse de déplacement des ovules fécondés, dans la trompe de Fallope.
Dans certains pays, les médecins sont convaincus dans le danger des mini-pilules pour les mères qui allaitent, bien qu'aux États-Unis et au Royaume-Uni, ces contraceptifs soient prescrits régulièrement.