La progestérone est principalement utilisée pour favoriser la fertilité chez les femmes ayant un faible taux de progestérone dans le sang. De faibles niveaux de progestérone rendent le tissu qui tapisse l'utérus plus mince et moins riche en nutriments que nécessaire pour l'implantation par l'œuf fécondé et la croissance de l'embryon. Le traitement à la progestérone après l'ovulation peut rendre la muqueuse utérine plus épaisse et plus propice à l'implantation. La progestérone est également nécessaire pendant la grossesse pour le développement normal du fœtus et pour détendre l'utérus. Des suppléments de progestérone peuvent donc être prescrits pendant plusieurs semaines en début de grossesse, jusqu'à ce que le placenta soit bien formé et capable de produire suffisamment de progestérone pour répondre aux besoins du fœtus en croissance.
Outre les utilisations liées à la grossesse, la progestérone est également prescrite pour contrôler les saignements chez les femmes qui n'ovulent pas. Chez les femmes qui souhaitent différer leur grossesse, les injections de progestérone à haute dose agissent en empêchant l'ovulation et en épaississant le mucus des voies génitales inférieures. Ce mucus épais rend plus difficile la remontée des spermatozoïdes à travers le col de l'utérus et l'utérus dans la trompe de Fallope.
Chez les femmes post-ménopausées avec un utérus qui reçoivent également un remplacement d'œstrogène, la progestérone est administrée pour contrôler la prolifération de la muqueuse utérine. Un traitement hormonal substitutif à court terme pendant la ménopause peut également réduire les effets secondaires tels que les bouffées de chaleur.
La progestérone peut être prise sous forme de gélules, d'injections ou de suppositoires vaginaux. Bien qu'un certain nombre de crèmes à la progestérone et de produits « naturels » à la progestérone soient disponibles, certains sans ordonnance, ceux-ci peuvent être inefficaces pour traiter les bouffées de chaleur, prévenir l'ostéoporose, augmenter le désir sexuel ou prévenir le cancer de l'endomètre et du sein. L'American Menopause Society et l'American College of Obstetricians and Gynecologists mettent en garde contre l'utilisation de tels composés avec des avantages non prouvés et des risques inconnus. Il est toujours conseillé de prendre de la progestérone sous la surveillance attentive d'un professionnel de la santé formé et agréé.
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