Desinfektionsmedel är kemikalier som används för att döda mikroorganismer på föremål eller i vätskor. Detta görs för att minska risken för att dessa mikroorganismer infekterar människor eller andra levande varelser. Halogener, en serie icke-metalliska element som är dödliga för levande organismer, används ofta i desinfektionsmedel. Halogenerna är fluor, klor, brom, jod och astatin. Mängden halogen som används i ett desinfektionsmedel är tillräcklig för att döda mikroorganismer men inte tillräckligt för att utgöra en betydande risk för större organismer.
Klorblekmedel är ett vanligt desinfektionsmedel. Cirka 3 till 6 procent natriumhypoklorit tillsätts som ett desinfektionsmedel för att producera denna form av blekmedel. Den används i en mängd olika industriella och konsumenttillämpningar. Konsumenter använder oftast blekmedel för att tvätta kläder. Industriella applikationer använder den för att bleka material, såsom trämassa, fett och bivax, för att göra dem ljusare. Inte allt blekmedel är baserat på klor för desinfektion. Oxid- och peroxidblekmedel använder icke-halogena kemikalier för desinfektion.
Klor är ett vanligt desinfektionsmedel för vattenrening. Syftet med klor i reningsprocessen är att döda patogena mikroorganismer i vattnet. Ren klor kan användas för detta ändamål, men även klorhaltiga föreningar används. Dessa föreningar är kloramin, klordioxid och natriumhypoklorit. Processen att använda klor eller klorföreningar som ett vattendesinfektionsmedel kallas för klorering.
Brom är ett alternativ till klor för vattendesinfektion. Det kom ursprungligen i användning för detta ändamål när klor blev ont om under andra världskriget. Brom används fortfarande som vattendesinfektion på grund av dess egenskaper. Brom absorberas snabbare i vatten än klor. Det är också lättare att ta bort från vattnet efter avslutad desinfektion. Brom är frätande för metaller och kräver högre koncentrationer än klor när det används som desinfektionsmedel.